Réutiliser des médicaments sûrs avec BIOVIA Living Map

Nouvelles orientations dans la lutte contre le COVID-19

La réorientation des médicaments et la biologie des systèmes peuvent aider à identifier des médicaments connus pour être sûrs et efficaces pour traiter le virus SARS-CoV-2. Heureusement, ces approches jumelles peuvent également ouvrir la voie à des traitements pour les futurs coronavirus pathogènes.

Réutiliser des médicaments sûrs  dans une pandémie mondiale

La réorientation des médicaments implique l'étude de médicaments existants, testés cliniquement et sûrs à de nouvelles fins thérapeutiques.

Les scientifiques utilisent le criblage basé sur la structure et virtuel pour sélectionner les médicaments existants en fonction de leur in silico propension à cibler la protéase virale et éventuellement à réduire la prolifération virale. Voir Dépistage virtuel guidé par pharmacophore pour la réorientation des médicaments et Inhibition de la protéase principale du SRAS-CoV-2 . Cependant, aucun médicament connu ne s'est vraiment distingué. Par conséquent, nous devons envisager d'autres stratégies.

La biologie des systèmes se concentre sur l'analyse informatique et la modélisation des interactions complexes au sein des systèmes biologiques. De plus, cette approche tire parti de la grande quantité de données et de connaissances accumulées dans le monde grâce à de nombreuses initiatives COVID-19.

Naviguer dans la biologie des systèmes avec une carte vivante

BIOVIA Living Map est un service sur Dassault Systèmes 3D EXPÉRIENCE ^® Plate-forme. Il fournit de puissantes capacités de modélisation et de simulation pour la biologie des systèmes. Surtout, il automatise également l'accès aux ressources de données et aux connaissances académiques.

Living Map permet aux biologistes de concevoir et de simuler des réseaux biologiques booléens. De plus, les voies de signalisation booléennes scientifiquement validées de l'application permettent aux scientifiques de construire des cartes qualitatives des maladies, de concevoir in silico expériences et tester de nouvelles hypothèses.

Surtout, les scientifiques peuvent annoter un modèle Living Map avec des liens factuels vers des bases de données de référence. Ils peuvent annoter des entités, des interactions et des motifs de modélisation. Il est important de noter que ces annotations critiques et probantes augmentent continuellement le niveau de confiance de BIOVIA Living Map.

Modélisation des effets du SARS-CoV-2 sur l'immunité innée

Les scientifiques de BIOVIA utilisent Living Map pour étudier la réutilisation de médicaments dans la lutte contre le SRAS-CoV-2.

Dans un projet, nous avons construit un modèle dynamique en assemblant des voies de signalisation génériques des cellules de coronavirus publiées avant COVID-19. Ensuite, nous avons personnalisé et validé notre modèle avec des connaissances plus spécifiques et récentes sur le SARS-CoV-2. Enfin, nous avons lancé des simulations pour étudier des candidats médicaments à réutiliser et proposer de nouvelles interventions thérapeutiques. Par la suite, Living Map n'a pas prédit de médicament approuvé pour inverser le coronavirus. Cependant, l'application a identifié une interaction virus-protéine hôte susceptible d'être efficace.

Simulation d'une infection non-coronavirus vs SARS-CoV-2

Cette vidéo montre comment nous avons simulé et testé une infection classique non-coronavirus. Lorsque nous avons simulé l'infection classique, nous avons constaté que la réponse immunitaire innée de l'hôte inhibait avec succès la réplication/propagation de l'infection.

Cependant, lorsque nous avons testé le virus SARS-CoV-2, nous avons constaté que le coronavirus inhibait la réponse immunitaire innée de l'hôte. Par la suite, cela a permis au coronavirus de se répliquer et de se propager avec succès. Conformément aux observations cliniques, le virus SARS-CoV-2 a augmenté la production de cytokines pro-inflammatoires. Cela a entraîné une tempête de cytokines dans laquelle le corps attaque ses propres cellules et tissus plutôt que de combattre le virus.

Faire progresser la découverte de cibles innovantes

Guidé par BIOVIA Living Map, vous pouvez collaborer, comprendre et annoter les mécanismes de la maladie, le mode d'action des médicaments et la résistance au traitement sur la 3D EXPÉRIENCE ^® Plate-forme. Vous pouvez créer et utiliser des modèles pour étudier des hypothèses de R&D par simulation. De plus, vous pouvez faire progresser la découverte de cibles innovantes tout en triant les scénarios thérapeutiques les plus prometteurs.

BIOVIA Living Map peut aider à réduire les temps d'investigation scientifique de plusieurs semaines. De plus, cela peut réduire les coûts de validation en laboratoire humide et augmenter les chances de réussite de la découverte.

Certes, lorsque vous vous lancez dans un voyage de découverte, vous avez besoin d'une bonne carte pour vous guider.

Réutilisez des médicaments sûrs avec BIOVIA Living Map !