Test COVID-19 unifié : détecter, suivre les variants et co-infections en une seule procédure

Un nouveau type de stratégie de test COVID-19 pourrait aider à rationaliser le processus d'identification des cas, de suivi des variants et de détection des virus co-infectieux. Actuellement, des tests distincts et des flux de travail complexes sont impliqués dans chacune de ces trois procédures de diagnostic, les analyses étant généralement effectuées dans des installations hautement spécialisées. Les chercheurs ont maintenant combiné les trois types de tests en une seule procédure qui devrait permettre un suivi au point de service de la COVID-19 et des nombreux variants émergents du SARS-CoV-2.

Le test implique un mini-laboratoire portable de la taille d'une mallette qui évite les techniques lentes et coûteuses standard pour le dépistage et la surveillance de la COVID-19. Le test tire parti d'une méthode génétique (appelée amplification par polymérase recombinase) et d'un séquenceur portable pour détecter rapidement la présence de séquences virales et fournir des résultats pour jusqu'à 96 échantillons de patients à la fois.

Le test a été conçu pour décoder cinq segments du génome du SARS-CoV-2, chacun choisi pour aider à guider le suivi des variants. Les chercheurs ont également incorporé des tests pour trois virus respiratoires courants qui peuvent causer des symptômes similaires à la COVID-19.

L'équipe a validé la technique — appelée NIRVANA — en utilisant des écouvillons nasaux et pharyngés de personnes suspectées d'avoir des infections au SARS-CoV-2. Ils ont également testé des échantillons d'eaux usées collectés dans les égouts municipaux pour montrer comment la méthode pourrait permettre une surveillance au niveau de la population du SARS-CoV-2 et d'autres virus.

Une limitation du test est qu'il ne peut détecter les mutations du SARS-CoV-2 que dans des régions génomiques sélectionnées et, à mesure que de nouveaux variants préoccupants continuent d'apparaître dans le monde, ces régions pourraient devoir être mises à jour pour refléter la nature évolutive du virus.