Test tout-en-un pour la surveillance du COVID-19

Un nouveau type de stratégie de test COVID-19 pourrait aider à rationaliser le processus d'identification des cas, de suivi des variantes et de détection des virus co-infectants. À l'heure actuelle, des tests distincts et des flux de travail complexes sont impliqués dans chacune de ces trois procédures de diagnostic, les analyses étant généralement effectuées dans des installations hautement spécialisées. Les chercheurs ont maintenant combiné les trois types de tests en une seule procédure qui devrait permettre le suivi au point de service du COVID-19 et des nombreuses variantes émergentes du SRAS-CoV-2.

Le test implique un mini-laboratoire portable de la taille d'une mallette qui évite les techniques lentes et coûteuses qui sont la norme pour le dépistage et la surveillance du COVID-19. Le test tire parti d'une méthode génétique (appelée amplification par recombinase polymérase) et d'un séquenceur portable pour détecter rapidement la présence de séquences virales et fournir des lectures dans jusqu'à 96 échantillons de patients à la fois.

Le test a été conçu pour décoder cinq segments du génome du SRAS-CoV-2, chacun choisi pour aider à guider le suivi des variantes. Les chercheurs ont également intégré des tests pour trois virus respiratoires courants qui peuvent provoquer des symptômes similaires au COVID-19.

L'équipe a validé la technique - appelée NIRVANA - en utilisant des écouvillons du nez et de la gorge de personnes suspectées d'avoir des infections au SRAS-CoV-2. Ils ont également testé des échantillons d'eaux usées prélevés dans les égouts municipaux pour montrer comment la méthode pourrait permettre une surveillance au niveau de la population du SRAS-CoV-2 et d'autres virus.

L'une des limites du test est qu'il ne peut détecter que les mutations du SRAS-CoV-2 dans des régions génomiques sélectionnées et que de nouvelles variantes préoccupantes continuent d'apparaître dans le monde, ces régions pourraient devoir être mises à jour pour refléter la nature évolutive du virus.