Blog :Détection de gènes par microarray

Hochuen Medical, Chine se spécialise dans un outil de laboratoire distinct, à savoir la puce à ADN pour détecter l'expression d'une multitude de gènes dans un laps de temps spécifique.

Un microarray est une sorte de technologie qui minimise les opérations qui ont longtemps été utilisées dans un laboratoire de génétique moléculaire. Il permet de détecter des molécules d'ADN ou d'ARN en s'hybridant ou en se fixant à des molécules d'ADN ou d'ARN spécifiques sur une lame de verre. Il détecte ensuite la molécule d'ADN ou d'ARN adhérente en appliquant divers colorants ou marqueurs qui permettent de les observer au microscope. Les molécules d'ADN sur chaque lame de verre (puce à gènes) servent de sondes pour détecter l'expression génique, communément appelée transcriptome ou le réseau de transcrits d'ARN messager (ARNm) exprimés par un ensemble de gènes. Les gènes exprimés dans l'échantillon sont identifiés par des zones produisant de la lumière sur la puce génétique ou la lame de verre.

Principes

L'ARNm fait référence à une molécule qui transporte l'information génétique du noyau d'une cellule vers le cytoplasme pour la régulation des protéines. Une méthode appelée transcription par microarray produit de multiples copies d'ARNm correspondant à des gènes spécifiques chaque fois qu'ils sont exprimés ou trouvés à l'état actif. La traduction génère la protéine appropriée à partir de ces ARNm. En conséquence, on peut analyser l'information génétique ou l'expression des gènes indirectement en évaluant des ARNm distincts. L'examen de l'expression par puce à ADN dans la plupart des gènes d'un échantillon est appelé recherche basée sur la découverte plutôt qu'évaluation fondée sur des hypothèses.

Techniques

La capacité de déposer de nombreuses séquences d'ADN distinctes sur une petite surface, généralement une lame de verre ou une puce génétique, est l'épine dorsale de la technologie des puces génétiques. Plusieurs fragments d'ADN sont organisés en rangées et en colonnes de telle sorte que l'authenticité de chaque fragment puisse être déterminée par son emplacement sur la puce. Seuls quelques gènes peuvent être testés par enquête à l'aide de techniques telles que le Northern blot et la RT-PCR. Cependant, le profilage d'expression global ou microarray examine non seulement les ordres de grandeur de gènes qui étaient auparavant concevables, mais a également la particularité de ne pas être influencé par la présélection des gènes.

Applications :

· Traitement antibiotique :Les bactéries anaérobies, en particulier les actinomyces, sont généralement difficiles à cultiver dans la cavité buccale où elles sont l'agent infectieux. L'analyse des puces à ADN est utile car l'ADN génomique bactérien survit généralement à la viabilité de la bactérie, ce qui permet d'établir un microdiagnostic avec une petite quantité d'ADN plutôt que le grand nombre de bactéries nécessaires à la culture.

· Thérapie contre le cancer :la formation de tumeurs marque des changements simultanés dans une gamme de cellules ainsi que des variantes génétiques. Les scientifiques peuvent bénéficier des puces à ADN car elles leur permettent de tester un grand nombre d'échantillons génétiques en même temps. Il est particulièrement utile dans la détection de polymorphismes mononucléotidiques et de mutations cellulaires, la catégorisation des tumeurs, l'identification de biomarqueurs du cancer, la découverte de gènes de chimiorésistance et la recherche de médicaments.

· Détection prématurée du cancer :une variété de maladies réversibles peut provoquer une leucoplasie ou des lésions blanches de la cavité buccale. Le petit sous-ensemble de ces lésions qui se transforment en cancer buccal est désormais indétectable par simple observation microscopique. Le microréseau aidera les chercheurs à distinguer les lésions blanches inoffensives des lésions précancéreuses ou des tumeurs malignes très précoces. Il identifiera les profils d'expression génique à la perfection.

Conclusion

Bien que désormais limité dans ses applications en raison de son coût, les perspectives pourraient s'améliorer à mesure que les produits commerciaux deviendront plus largement disponibles. La maîtrise de la biologie moléculaire nécessite des compétences éprouvées pour enregistrer un grand nombre d'échantillons historiques et les analyser à la recherche de variations génétiques distinctes. Les puces à ADN sont très prometteuses lorsqu'il s'agit de diagnostiquer les troubles bucco-dentaires. Les catégories de maladies bucco-dentaires basées sur les profils d'ADN, d'ARN ou de protéines amélioreront considérablement la capacité des scientifiques à diagnostiquer, surveiller, analyser et traiter les patients de manière plus méthodique. Hochuen Medical en Chine travaille sans relâche pour atteindre cet objectif.